ImageJ – програма для аналізу та обробки графічних файлів. Програма здатна ефективно проаналізувати зображення та отримати детальні технічні дані. ImageJ підтримує більшість графічних форматів та володіє набором інструментів для редагування. Програма дозволяє здійснювати різні геометричні перетворення, створювати гістограми щільності, проводити тривимірну візуалізацію, виконувати логічні та арифметичні операції між зображеннями тощо. ImageJ здатна одночасно працювати з безліччю зображень, застосовувати різні фільтри та проводити пакетну обробку файлів. ImageJ містить безліч розширень, які значно розширюють можливості програми.